هناك ارتباط بين عسر الهضم ومرض القولون العصبي (IBS)، حيث يمكن أن يكون عسر الهضم أحد الأعراض المصاحبة لهذا الاضطراب. في هذه الحالة، قد يعاني الشخص من ألم أو تشنجات في البطن، انتفاخ، وتغير في حركة الأمعاء مثل الإسهال أو الإمساك. من المهم التفرقة بين عسر الهضم الناتج عن القولون العصبي والأنواع الأخرى من عسر الهضم التي قد لا تكون مرتبطة بالقولون.